百佳食物安全中心於2000年設立，為全港首間同類的食物安全中心，專注於新鮮食物安全標準。食物安全中心的食品科學專員致力訂立並管理下體制：

設立此計劃的目的，是協助新鮮食品供應商發展及提升香港、內地及亞洲其他地區的食物安全標準。百佳的食物科學專員會到供應商的工場進行詳細的實地監察及審查，並作出詳盡的報告，列出任何可改善空間，並為供應商評級。所有百佳的新鮮食品供應商必須獲得此計劃認可，方能為百佳供應產品。